O Fundo Geral da Biblioteca do C.A.M. compreende uma vasta e diversificada colecção, disponibilizando, em livre acesso, cerca de vinte mil documentos, repartidos por diversos suportes e tipologias: monografias, publicações em série, teses, trabalhos não publicados, vídeos, CD-ROM e DVD.
O Fundo Especial é composto por dois importantes corpos documentais de foro patrimonial: a Biblioteca Cláudio Torres e a Biblioteca José Mattoso.
A Biblioteca Cláudio Torres compreende um espólio bibliográfico de cerca de dez mil documentos, alguns dos quais provenientes da biblioteca do pai do seu possuidor, Flausino Torres. Entre documentos inéditos dedicados às mais diversas temáticas, destaca-se um vastíssimo conjunto de periódicos, entre os quais colecções completas de revistas de arqueologia, que são actualmente um verdadeiro ex-líbris.
A Biblioteca José Mattoso foi doada por este investigador ao CAM em 1998 e compreende cerca de quinze mil documentos, representando um fundo especializado em História medieval. Este fundo encontra-se ainda em fase de tratamento documental, mas em breve será integralmente disponibilizado online aos utilizadores.